Hierarchy For Package picard.illumina.parser

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • picard.illumina.parser.BaseIlluminaDataProvider (implements java.lang.AutoCloseable, java.lang.Iterable<T>, java.util.Iterator<E>)
    • picard.illumina.parser.IlluminaDataProvider
    • picard.illumina.parser.NewIlluminaDataProvider
  • picard.illumina.parser.BclData
    • picard.illumina.parser.CbclData
  • picard.illumina.parser.ClusterData
  • picard.illumina.parser.FourChannelIntensityData
  • picard.illumina.parser.IlluminaDataProviderFactory
  • picard.illumina.parser.IlluminaFileUtil
  • picard.illumina.parser.MultiTileBclParser
  • picard.illumina.parser.MultiTileParser<OUTPUT_RECORD>
    • picard.illumina.parser.MultiTileFilterParser
    • picard.illumina.parser.MultiTileLocsParser
  • picard.illumina.parser.OutputMapping
  • picard.illumina.parser.ParameterizedFileUtil
    • picard.illumina.parser.MultiTileBclFileUtil
    • picard.illumina.parser.MultiTileFileUtil<OUTPUT_RECORD>
    • picard.illumina.parser.PerTileFileUtil
      • picard.illumina.parser.PerTileOrPerRunFileUtil
    • picard.illumina.parser.PerTilePerCycleFileUtil
  • picard.illumina.parser.PerTileParser<ILLUMINA_DATA>
    • picard.illumina.parser.PosParser
  • picard.illumina.parser.Range
  • picard.illumina.parser.ReadData
  • picard.illumina.parser.ReadDescriptor
  • picard.illumina.parser.ReadStructure
  • picard.illumina.parser.ReadStructure.Substructure (implements java.lang.Iterable<T>)
  • picard.illumina.parser.Tile
  • picard.illumina.parser.TileIndex (implements java.lang.Iterable<T>)
  • picard.illumina.parser.TileIndex.TileIndexRecord
  • picard.illumina.parser.TileMetricsUtil
  • picard.illumina.parser.TilePhasingValue

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • picard.illumina.parser.IlluminaDataType
    • picard.illumina.parser.IlluminaFileUtil.SupportedIlluminaFormat
    • picard.illumina.parser.IlluminaMetricsCode
    • picard.illumina.parser.IntensityChannel
    • picard.illumina.parser.ReadType
    • picard.illumina.parser.TileTemplateRead